1. سیاستگذاری، هدايت و نظارت كليه امور پژوهشی دانشگاه و ايجاد هماهنگی بين فعاليت‌های واحدهای زير مجموعه
2. ايجاد و توسعه زیرساخت های لازم جهت تولید علم و انجام پژوهش
3. ارزشيابي فعاليت‎هاي پژوهشي دانشکده‎ها و پژوهشکده‎ها و ارزيابي سالانه عملکرد پژوهشي دانشگاه
4. تهيه و تنظيم برنامه‎هاي پژوهشي دانشگاه و ارائه اهداف و تعيين اولويت‎هاي پژوهشي

معاونت پژوهش و فناوری دانشگاه صنعتی اصفهان، به منظور گسترش و تعمیق پژوهش و فناوری متناسب با اولویت­ها و نیازهای جامعه و دستیابی به دانش و فناوری­های نوین، با برخورداری از توان علمی نخبگان دانشگاهی، تلاش می­کند تا با ایجاد فضای مساعد علمی، راه را برای چرخه علم و فناوری مساعد سازد. این اهداف با ایفای نقش موثر مدیریت­های مجموعه در بخش­های مختلف، با بکار گیری تمام ظرفیت­ها، به سمت اجرایی شدن گام برمی­دارد تا براساس نقشه جامع علمی کشور به رسالت خود دست یابد.  مدیریت­های این مجموعه عبارتند از:  

شيوه نامه درخواست استفاده از امكانات مركز ملی ابر رايانش شيخ بهایی

• خدمات پردازش اختصاصي
• خدمات محاسباتي
• خدمات آموزشي
• خدمات مشاوره اي
• طراحي، نصب و راه اندازي كلاستر
• ميزباني كلاستر

• محاسبات هواشناسی، زلزله‌سنجی و علوم مرتبط
• نانو محاسباتی
• فیزیک و شیمی محاسباتی
• بیوتکنولوژی و ژنتیک
• علوم هسته‌ای
• دینامیک سیالات و مکانیک محاسباتی
• صنایع هوافضا و خودرو
• صنایع استراتژیک و دفاعی
• پردازش تصویر و گرافیک کامپیوتری
• بانک‌های اطلاعاتی حجیم

مرکز ابر رايانش ملی شيخ بهايی، مرکزی منحصر به فرد در کشور بوده که با حمایت معاونت علمی و فنآوری ریاست جمهوری تاسیس و نگه‌داری شده تا با بهره‌گیری از پردازش موازی بر روی ابررایانه‌های پرقدرت از نوع کلاستر امکان اجرا و انجام محاسبات حجیم و پیشرفته را برای متخصصین و صنعتگران کشور فراهم سازد.

• اندازه­ گیری
• تجزیه و تحلیل داده­ های تجربی 
• شبیه سازی آن ها